剧场版《FLCL AlterNative》由Production I.G与GAINAX共同负责制作的动画剧场版。

Production I.G 剧场版完全新作『FLCL 2&3』特报 2018年公开

故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种（联合国称其为BETA）的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间…

卫国战争时期，青年演员伊戈尔随同剧院撤退到乌兹别克。在那他遇见了奥丽迦，奥丽迦战前是莫斯科的音乐教师，她不适应乌兹的气候，自己认为只要能回到莫斯科，她的病就立即会好。莫斯科的保卫战传来捷报，剧院先得到批准返回莫斯科。善良…

《侦探歌剧：少女福尔摩斯》以架空的怪盗和侦探活跃的近未来为背景。在这个世界里存在着拥有被叫做“Toys”的特殊能力的人类。利用这种特殊的能力，“侦探”和“怪盗”争斗不断。而故事就是以将来要成为侦探的四个少女夏洛克、妮洛、艾露…

故事讲述了主人公白银武进入了一个平行世界，在这个世界里人类与外星生命体“BETA”进行了十余年的战争，并濒临灭亡，于是他参与了对抗BETA的最后的手段“ALTERNatiVE4”计划，成为名为“战术机”的巨大人型兵器驾驶员。