富士山下的小村庄正在进行热闹的祭典，突如其来的山火却让人们陷入恐慌之中，而天文学家白石良一（平田昭彦 饰）则在混乱中失踪。不久，当地发生滑坡、天坑等离奇事件，更有一个巨大、恐怖的机器人出现，对周遭城镇进行大肆破坏。白石的…

科学出格搜查队的早田队员，乘着飞机巡逻时，发明一个红色球体正在追赶一个蓝色球体，这时辰红色球体偶尔中撞上了早田飞机，早田为此死往。这个时辰，他在龙森湖的上空被红球吸了进往，因此碰到了奥特曼，在这里他大白了奥特曼是在追击逃…

奥特曼在普通人眼中是高大的巨人，就如同神一般的存在，可是他们对于自己的种族，自己的星球来说也只不过是一个普通人。超进化给他们带来了完善的生命形态，同时也使他们背负起了沉重的历史责任，在这种历史责任感驱使下，光之巨人的足迹…